لم تكن الرياضيات من بين اهتمامات نابيير الأساسية لكنه أنشأ عدة صيغ في علم المثلثات الكروية وكان الهدف منها تبسيط الحسابات الفلكية، كما ألف أول جدول للوغارتميات سمي بجدول نابير الذي استخدم لتسهيل العمليات الحسابية كالضرب والقسمة.