تحظى الجامعة بالاعتراف الدولي من خلال مجموعة من الجهات المرموقة، مما يبرز مكانتها كمؤسسة تعليمية متميزة على الساحة العالمية. وتعتبر هذه الاعتمادات دليلاً على التزام الجامعة بتقديم تعليم عالي الجودة يلبي المعايير العالمية.
الهيئة الأمريكية للاعتماد الأكاديمي (ACEE): حصلت جامعة النيل على الاعتماد الأكاديمي من الهيئة الأمريكية للاعتماد الأكاديمي (ACEE) لبرنامج بكالوريوس إدارة الأعمال، مما يجعلها من بين أفضل برامج إدارة الأعمال في العالم.
رابطة الجامعات الأوروبية (EUA): جامعة النيل عضو في رابطة الجامعات الأوروبية (EUA)، وهي شبكة تضم أكثر من 800 جامعة من 48 دولة أوروبية.
اتحاد الجامعات العربية: جامعة النيل عضو في اتحاد الجامعات العربية، وهو اتحاد يضم أكثر من 200 جامعة من الدول العربية.
مجلس التعليم العالي المصري: جامعة النيل معترف بها ومعتمدة من قبل مجلس التعليم العالي المصري، مما يعني أن شهاداتها معترف بها في جميع أنحاء مصر.